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mwbwTN-Grid cite-ref-1[1] è un contenitore di progetti di mwdavolunteer computing su piattaforma mwdqBOINC, sviluppato e sostenuto dalla Area di Ricerca di mwdgTrento del mwdwConsiglio Nazionale delle Ricerche e ospitato dall'mweaUniversità di Trento.

• Progetti

• Finalità scientifiche

• Piattaforme compatibili

• Applicativi ottimizzati

• Note

• Collegamenti esterni

Attivo dal 2014, ospita il progetto mwfagene@homecite-ref-2[2], in collaborazione con la mwgqFondazione Edmund Mach, che si occupa di estendere le reti geniche (mwggGRN), utilizzando come punto di partenza mwgworganismi modello ben noti (come mwhamwhqEscherichia coli) per poi confrontare i risultati mwhgin silico con quelli mwhwin vitro, aumentando così la comprensione dei processi biologici sottostanti. L'algoritmo che si occupa di trovare le relazioni causali tra geni è chiamato PC-IM e si basa sul mwiacoefficiente di Pearson. Il codice sorgente del progetto è mwiqopen source.

La conoscenza delle espansioni delle rete geniche di organismi modello (e le loro variazioni), consente di applicare gli stessi algoritmi anche ad altre piante, animali e finanche all'essere umano, permettendo una migliore conoscenza di questo settore di ricerca, con possibili conseguenze in campo medico o, come con mwjaVitis vinifera, per permettere un minor ricorso ai pesticidi.

A tutt'oggi le simulazioni hanno riguardato:

• mwkaArabidopsis thaliana (completata)

• mwkgEscherichia coli (in corso)

• mwlaVitis vinifera (completata)

• mwlgPseudomonas aeruginosa (in corso)

• Homo sapiens (in corso). In particolare i ricercatori si stanno concentrando sulle ricerche riguardanti il tumore della prostata e le malattie coronariche.

L'applicativo del progetto, oltre a funzionare sulle principali piattaforme software (mwmgWindows, mwmwLinux, mwnaMac OS X), è compatibile con l'mwnqarchitettura ARM con distribuzioni Linux (come, ad esempio, mwngRaspberry).

Grazie alla collaborazione di alcuni volontari, è stato possibile creare degli applicativi ottimizzati per CPU, utilizzando le estensioni SSEx, mwoqAVX e FMA, che migliorano in maniera sensibile la velocità di esecuzione dei calcoli.

cite-note-11. ↑ mwqa(mwqqmwqgEN) mwqwmwraTN-Grid. National Research Council of Italy (CNR), su mwrqmwrgUniversità degli studi di Trento, 2017. mwrwURL consultato il 21 novembre 2017./

cite-note-22. ↑ mwsw(mwtamwtqEN) mwtgmwtwgene@home. Il progetto per espandere reti di geni, su mwuamwuqUniversità degli studi di Trento, 2017. mwugURL consultato il 21 novembre 2017.

• (EN) Sito ufficiale, su gene.disi.unitn.it.